MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_015508	CGG	2	6	2138481	2138486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717303
45002	NC_015508	TTG	2	6	2138509	2138514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45003	NC_015508	ATC	2	6	2138569	2138574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717304
45004	NC_015508	CGC	2	6	2138598	2138603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717304
45005	NC_015508	GA	3	6	2138657	2138662	50 %	0 %	50 %	0 %	332717304
45006	NC_015508	TCAC	2	8	2138701	2138708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45007	NC_015508	CGG	2	6	2138723	2138728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45008	NC_015508	GAA	2	6	2138864	2138869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332717305
45009	NC_015508	GCC	3	9	2138877	2138885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717305
45010	NC_015508	TCA	2	6	2138889	2138894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717305
45011	NC_015508	AAGCCA	2	12	2138929	2138940	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332717305
45012	NC_015508	GTT	2	6	2138950	2138955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45013	NC_015508	GAG	2	6	2138960	2138965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45014	NC_015508	GGT	2	6	2138966	2138971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45015	NC_015508	CGG	2	6	2139036	2139041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45016	NC_015508	CGG	2	6	2139064	2139069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717306
45017	NC_015508	CTGC	2	8	2139133	2139140	0 %	25 %	25 %	50 %	332717306
45018	NC_015508	CGT	2	6	2139157	2139162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717306
45019	NC_015508	CGA	2	6	2139211	2139216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717306
45020	NC_015508	GACCGG	2	12	2139226	2139237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332717306
45021	NC_015508	GCG	2	6	2139296	2139301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717306
45022	NC_015508	GTC	2	6	2139311	2139316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717306
45023	NC_015508	GGC	2	6	2139404	2139409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45024	NC_015508	CG	3	6	2139488	2139493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45025	NC_015508	ATC	2	6	2139515	2139520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45026	NC_015508	TA	3	6	2139535	2139540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45027	NC_015508	ATAA	2	8	2139545	2139552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45028	NC_015508	ATG	3	9	2139616	2139624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45029	NC_015508	GAT	2	6	2139699	2139704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45030	NC_015508	CG	3	6	2139812	2139817	0 %	0 %	50 %	50 %	332717307
45031	NC_015508	GCT	2	6	2139828	2139833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717307
45032	NC_015508	GA	3	6	2139840	2139845	50 %	0 %	50 %	0 %	332717307
45033	NC_015508	TGC	2	6	2139878	2139883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717307
45034	NC_015508	TCG	2	6	2139910	2139915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717307
45035	NC_015508	TCG	2	6	2139961	2139966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717307
45036	NC_015508	CTA	2	6	2140081	2140086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717308
45037	NC_015508	GC	3	6	2140157	2140162	0 %	0 %	50 %	50 %	332717308
45038	NC_015508	GCT	2	6	2140225	2140230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717308
45039	NC_015508	CGG	2	6	2140341	2140346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717308
45040	NC_015508	CCGG	2	8	2140390	2140397	0 %	0 %	50 %	50 %	332717308
45041	NC_015508	TTG	2	6	2140515	2140520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332717308
45042	NC_015508	CGA	2	6	2140668	2140673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717308
45043	NC_015508	GCG	2	6	2140690	2140695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717308
45044	NC_015508	TCT	2	6	2140699	2140704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717308
45045	NC_015508	AGG	2	6	2140761	2140766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332717308
45046	NC_015508	GAT	2	6	2140843	2140848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717308
45047	NC_015508	TCGG	2	8	2141064	2141071	0 %	25 %	50 %	25 %	332717308
45048	NC_015508	GCG	2	6	2141089	2141094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717308
45049	NC_015508	GGCA	2	8	2141103	2141110	25 %	0 %	50 %	25 %	332717308
45050	NC_015508	TGA	2	6	2141116	2141121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717308
45051	NC_015508	GCG	2	6	2141133	2141138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717308
45052	NC_015508	AT	3	6	2141206	2141211	50 %	50 %	0 %	0 %	332717308
45053	NC_015508	CGA	2	6	2141232	2141237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717308
45054	NC_015508	CAT	2	6	2141405	2141410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45055	NC_015508	TGT	2	6	2141476	2141481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45056	NC_015508	GCA	2	6	2141535	2141540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45057	NC_015508	CGGC	2	8	2141626	2141633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45058	NC_015508	GT	3	6	2141651	2141656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45059	NC_015508	AGC	2	6	2141739	2141744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45060	NC_015508	TCT	2	6	2141747	2141752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45061	NC_015508	TTG	2	6	2141784	2141789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45062	NC_015508	GCT	2	6	2141869	2141874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45063	NC_015508	CG	4	8	2141907	2141914	0 %	0 %	50 %	50 %	332717309
45064	NC_015508	CGAT	2	8	2141935	2141942	25 %	25 %	25 %	25 %	332717309
45065	NC_015508	CTG	2	6	2141989	2141994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717309
45066	NC_015508	TCG	2	6	2142019	2142024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717309
45067	NC_015508	TCGGGT	2	12	2142167	2142178	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332717309
45068	NC_015508	CTGA	2	8	2142192	2142199	25 %	25 %	25 %	25 %	332717309
45069	NC_015508	CGA	2	6	2142249	2142254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717309
45070	NC_015508	TCCG	2	8	2142266	2142273	0 %	25 %	25 %	50 %	332717309
45071	NC_015508	CGT	2	6	2142277	2142282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717309
45072	NC_015508	TACC	2	8	2142308	2142315	25 %	25 %	0 %	50 %	332717309
45073	NC_015508	TGC	2	6	2142316	2142321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717309
45074	NC_015508	GGC	2	6	2142354	2142359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717309
45075	NC_015508	GTTT	2	8	2142374	2142381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45076	NC_015508	AAC	2	6	2142399	2142404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45077	NC_015508	TGG	2	6	2142446	2142451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45078	NC_015508	CTG	2	6	2142494	2142499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717310
45079	NC_015508	CGG	2	6	2142577	2142582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717310
45080	NC_015508	TCGG	2	8	2142614	2142621	0 %	25 %	50 %	25 %	332717310
45081	NC_015508	TA	3	6	2142665	2142670	50 %	50 %	0 %	0 %	332717310
45082	NC_015508	ACG	2	6	2142672	2142677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717310
45083	NC_015508	ACC	2	6	2142693	2142698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332717310
45084	NC_015508	TGA	2	6	2142717	2142722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717310
45085	NC_015508	GAG	2	6	2142743	2142748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332717310
45086	NC_015508	GAT	2	6	2142764	2142769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717310
45087	NC_015508	CAG	2	6	2142822	2142827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717310
45088	NC_015508	TGG	2	6	2142889	2142894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332717310
45089	NC_015508	CG	3	6	2142952	2142957	0 %	0 %	50 %	50 %	332717310
45090	NC_015508	TGCG	2	8	2143024	2143031	0 %	25 %	50 %	25 %	332717310
45091	NC_015508	CGT	2	6	2143131	2143136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717310
45092	NC_015508	GAC	2	6	2143159	2143164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717310
45093	NC_015508	TCGA	2	8	2143180	2143187	25 %	25 %	25 %	25 %	332717310
45094	NC_015508	GTG	2	6	2143224	2143229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332717310
45095	NC_015508	AGA	2	6	2143230	2143235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332717310
45096	NC_015508	TTGC	2	8	2143241	2143248	0 %	50 %	25 %	25 %	332717310
45097	NC_015508	TTTCA	2	10	2143336	2143345	20 %	60 %	0 %	20 %	332717310
45098	NC_015508	TCA	2	6	2143357	2143362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717310
45099	NC_015508	CTT	2	6	2143403	2143408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717310
45100	NC_015508	CTT	2	6	2143532	2143537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717310
45101	NC_015508	ATG	2	6	2143595	2143600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717311
45102	NC_015508	CAT	2	6	2143619	2143624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717311
45103	NC_015508	AG	3	6	2143709	2143714	50 %	0 %	50 %	0 %	332717311
45104	NC_015508	TCT	2	6	2143781	2143786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45105	NC_015508	GCG	2	6	2143840	2143845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45106	NC_015508	T	6	6	2143881	2143886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45107	NC_015508	ACAA	2	8	2143973	2143980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45108	NC_015508	ATG	2	6	2144033	2144038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717312
45109	NC_015508	TCA	2	6	2144155	2144160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717312
45110	NC_015508	GCG	2	6	2144240	2144245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717312
45111	NC_015508	ATC	2	6	2144265	2144270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717312
45112	NC_015508	GCTGGG	2	12	2144292	2144303	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	332717312
45113	NC_015508	TCG	2	6	2144368	2144373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717312
45114	NC_015508	ATA	2	6	2144375	2144380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332717312
45115	NC_015508	ATG	2	6	2144498	2144503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717312
45116	NC_015508	TCA	2	6	2144561	2144566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717312
45117	NC_015508	GTC	2	6	2144590	2144595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717312
45118	NC_015508	CTA	2	6	2144601	2144606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717312
45119	NC_015508	CAA	2	6	2144660	2144665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332717312
45120	NC_015508	AAAGT	2	10	2144719	2144728	60 %	20 %	20 %	0 %	332717312
45121	NC_015508	GTG	2	6	2144747	2144752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332717312
45122	NC_015508	CAA	2	6	2144757	2144762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332717312
45123	NC_015508	GAG	2	6	2144820	2144825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45144	NC_015508	TGTT	2	8	2145674	2145681	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45145	NC_015508	CTTT	2	8	2145726	2145733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45146	NC_015508	CGG	2	6	2145746	2145751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45147	NC_015508	TAT	2	6	2145816	2145821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45148	NC_015508	TATTTG	2	12	2145840	2145851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45149	NC_015508	ATA	2	6	2145856	2145861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45150	NC_015508	GAA	2	6	2146005	2146010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45151	NC_015508	GAGGCG	2	12	2146059	2146070	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45152	NC_015508	GCC	2	6	2146097	2146102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45153	NC_015508	GAT	2	6	2146113	2146118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45154	NC_015508	AGC	2	6	2146138	2146143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45155	NC_015508	CAG	2	6	2146175	2146180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717314
45156	NC_015508	CGG	2	6	2146272	2146277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717314
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45189	NC_015508	CATT	2	8	2148111	2148118	25 %	50 %	0 %	25 %	332717316
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45192	NC_015508	GC	3	6	2148283	2148288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.